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基于全长转录本测序的小鼠视网膜基因间lncRNA系统鉴定
 
     论文目录
 
致谢第5-6页
摘要第6-7页
Abstract第7页
附表第10-13页
缩略语表第13-14页
1 引言第14-26页
    1.1 视网膜的结构第14页
    1.2 视网膜的发生第14-15页
    1.3 转录因子在视网膜发育过程中的调节作用第15-18页
    1.4 lncRNA概述第18-22页
        1.4.1 lncRNA的概念和分类第18-19页
        1.4.2 lncRNA的生物学功能第19-20页
        1.4.3 lncRNA的作用机制第20-21页
        1.4.4 lncRNA在视网膜中的研究进展第21-22页
    1.5 lncRNA鉴定的常规方法第22-26页
        1.5.1 SAGE和Tiling Arrays第22-23页
        1.5.2 RNA-Seq第23-24页
        1.5.3 第三代测序技术第24-26页
2.实验内容与设计第26-29页
    2.1 实验目的及意义第26页
    2.2 实验内容第26-28页
    2.3 技术路线第28-29页
3.实验试剂仪器与方法第29-43页
    3.1 实验材料第29页
    3.2 实验试剂与配方第29-34页
        3.2.1 视网膜组织及胚胎材料获取试剂配方第29-30页
        3.2.2 RNA准备及测序试剂配方第30页
        3.2.3 反转录PCR试剂配方第30页
        3.2.4 荧光原位杂交(FISH)试剂配方第30-33页
        3.2.5 实验仪器第33-34页
    3.3 实验方法第34-43页
        3.3.1 视网膜组织及胚胎材料获取第34页
        3.3.2 RNA的准备及测序第34-36页
        3.3.3 iso-seq数据处理和校正第36页
        3.3.4 lncRNA鉴定第36-37页
        3.3.5 短reads映射及丰度计算第37页
        3.3.6 lincRNA邻近基因的功能分析第37-38页
        3.3.7 鉴别差异表达的lincRNAs第38页
        3.3.8 反转录PCR第38-40页
        3.3.9 荧光原位杂交第40-43页
4.实验结果第43-56页
    4.1 全长转录本测序和错误矫正第43页
    4.2 lncRNA基因的鉴定第43-45页
    4.3 视网膜lincRNAs的一般特征第45-48页
    4.4 lincRNAs的丰度第48-50页
    4.5 lincRNA侧翼基因的功能分析第50-51页
    4.6 与RGC分化相关lincRNAs的鉴定第51-56页
5.总结与讨论第56-58页
参考文献第58-65页
作者简历第65页

 
 
论文编号BS4288095,这篇论文共65
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